这天毛利一家收到婚礼邀请，坐新干线去参加婚礼。江户川柯南内里是高中生，不会因为坐新干线而感到兴奋，老老实实坐在位置上吃便当，别提多省心了。毛利兰本来还担心带小孩出远门不好带，结果江户川柯南不像其他熊孩子一样。
结果毛利兰刚松了口气，江户川柯南就开始闹幺蛾子。
江户川柯南一直希望找到黑衣组织的线索，但即使跟着毛利小五郎查了很多案子，都没有抓到黑衣组织的尾巴。现在只是随便出趟门，居然直接撞上了琴酒和伏特加，当时他以为自己要被杀了，结果这两人都没认出他。
也是，他现在变成小孩子，正常人怎么回想到呢？而且琴酒和伏特加又没见过他小时候长什么样子。
此时的江户川柯南行事还比较莽，为了得到线索直接去跟琴酒和伏特加，结果被毛利兰揪回来，“不许乱跑！你给我乖乖待在这。”
江户川柯南很是无奈，但他现在的身份无法轻易让人按照他的话去做的，幸好他已经把窃听器放在了琴酒的位置上。见毛利兰和毛利小五郎聊天，他开始专心窃听。
伏特加吸了口烟：“终于能抽烟了。刚刚那个箱子里是什么东西，居然能卖出4亿。”
琴酒冷冷地掀起眼皮看了他一眼，伏特加立刻不敢说话了。琴酒看过漫画，知道会在新干线上遇到柯南，但他不能不做组织交给他的任务，所以还是按照原计划进行。他甚至没有改造手提箱里的炸弹，他只要修改炸弹的触发方式，就能把炸弹提前引爆，而不是像漫画里那样在最后一秒把炸弹踢出去。
但灭口只是他谨慎小心的做法，其实交易对象对组织什么都不了解，就像漫画中警察什么都没问出来。他如果提出要换掉已经做好的炸弹，是有点奇怪，而且也挺麻烦。
江户川柯南刚听了个开头就什么都听不见了，不由着急。
他们是来交易的，交易什么？和谁交易？
现在只有找到那个交易对象，才能有证据。但列车员是不会相信一个小孩说的话的，他不得不自己去找，结果才排除了几个人就被赶出了vip车厢。他咬着牙，光从有手提箱和去过餐车这两点信息太少了。
新干线停下，琴酒和伏特加下车，江户川柯南不甘地看着他们离开，虽然很想追上去，但剩下的理智提醒他，他就算追上去成功的几率也很低。他再次进入vip车厢，终于通过语言漏洞确认了交易对象。他没法直接要走手提箱，只能抢了就跑。
江户川柯南躲进厕所，门被拍的“乓乓”响。他想要先打开看看里面是什么东西，但突然有一种直觉让他停了下来，这种侦探直觉多次救了他。
江户川柯南把耳朵贴在手提箱上，并没有什么声音，“不会那么倒霉是炸弹吧？”虽然这样说，但他却因为刚才的不详感不敢打开手提箱。
就在这时厕所移门被毛利兰暴力拉开，“柯南！”江户川柯南浑身一抖，但在狭小的厕所里无处可躲，被毛利兰抓了出去，眼看就要被打，他立刻大喊一声：“手提箱里有炸弹！”
其实他也不知道手提箱里是什么东西，只是一着急就说出来了，这样可能就能迫使警察检查箱子里面。
由于江户川柯南之前的表现太像个熊孩子了，所以大部分人是不信他的，但保险起见，还是报了警，在下一站停车，已经有拆弹警察等着了。
江户川柯南发挥小孩的死缠烂打，硬是要留下看结果，主角光环发挥作用，警察居然真的让他留下来了。
警察小心翼翼地检查了手提箱，发现里面安装的炸弹能把一整节车厢炸上天，里面安装了手机作为引爆器，只要拨通就会爆炸。
到了这时，江户川柯南背上出了一层冷汗。他只是为了让警察调查手提箱内的东西，没想到自己乱说的成真了。简直险之又险，他们所有人就会死了。
手提箱的所有人立刻被警察审问，但她只知道是两个黑衣人卖给她关于金钱的情报，至于黑衣人是什么来历，她完全不清楚。于是线索就此断绝，成了无头公案。
江户川柯南利用毛利小五郎的声音给目暮警官打电话询问此事，知道之后虽然早有预料，但仍然非常失望。
另一边，琴酒把4亿日元交公，他发现自己有了漫画app，能够知道一小部分未来，但除了给组织赚了很多钱，好像也没什么用。至于为什么把钱全上交了……10亿元抢劫案和这次交易都是组织的任务，金币自己出手很麻烦，所以干脆交掉，他也不差钱。
最新的漫画本来是江户川柯南通过琴酒和伏特加的对话，知道了他们的代号，还知道手提箱里有炸弹。但现在这几话的内容变了，由于琴酒打断了伏特加说话，直到下车他们都没聊天，所以江户川柯南不知道代号和炸弹，只是从箱子交换了和伏特加说终于可以抽烟，推测出手提箱在哪里。
琴酒快速翻到评论区，发现读者好像没有发现漫画内容变更过。因此他推测，或许因为他的操作导致历史改变，漫画跟着改变，而他处在时间线的前段，所以当历史改变后，读者原来看过漫画的记忆就被覆盖了。